Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PrameQ9D4Z5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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