Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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