Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tmed11Q9D2R4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tmed11Q9D2R4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed11Q9D2R4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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