Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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