Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms