Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms