Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms