Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms