Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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