Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms