Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sgo1Q9CXH7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sgo1Q9CXH7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sgo1Q9CXH7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sgo1Q9CXH7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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