Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Malsu1Q9CWV0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms