Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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