Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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NubplQ9CWD8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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