Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhobtb3Q9CTN4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms