Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms