Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms