Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms