Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl35Q9CQL6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl35Q9CQL6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl35Q9CQL6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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