Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms