Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms