Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms