Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm22Q9CPQ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms