Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms