Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms