Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms