Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms