Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lims1Q99JW4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lims1Q99JW4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms