Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdk9Q99J95 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdk9Q99J95 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cdk9Q99J95 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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