Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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