Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfdQ925I7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfdQ925I7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PdgfdQ925I7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfdQ925I7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms