Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Trim7Q923T7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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