Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms