Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med28Q920D3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms