Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Afg3l1Q920A7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Afg3l1Q920A7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Afg3l1Q920A7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Afg3l1Q920A7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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