Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul7Q8VE73 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms