Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms