Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc39cQ8VE09 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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