Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms