Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc18Q8VD24 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc18Q8VD24 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms