Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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