Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh10Q8VCH7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rdh10Q8VCH7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rdh10Q8VCH7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rdh10Q8VCH7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh10Q8VCH7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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