Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf4Q8R368 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms