Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Nup58Q8R332 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Nup58Q8R332 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Nup58Q8R332 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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