Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r200Q8R281 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r200Q8R281 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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