Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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