Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcsapQ8QZT2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcsapQ8QZT2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms