Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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