Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sash3Q8K352 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms