Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtmr3Q8K296 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms